第131章:基因编辑:修正序列的开发
  清晨六点,实验室的灯还亮著。林风靠在操作台边,手里拿著一支装有蓝色晶体的试剂瓶。他的眼睛有些发涩,但没去揉,只是盯著瓶身上的標籤看了几秒。
  周雨晴推门进来,手里抱著一台旧主机。她把机器放在空桌上,拍了下外壳。
  “找到了。”她说,“老款基因测序仪的控制模块,能读取基础序列。”
  林风走过去,把试剂瓶放下。“能用?”
  “主板烧了一块,但我昨晚修好了供电。”她插上电源,按下开关。屏幕闪了几下,跳出一行字符。
  “系统启动正常。”她说,“数据接口也通。”
  陈小满从门外探头。“我带了採集器。”他把手里的盒子打开,里面是几根细管和一个手持式採样笔,“废品站收来的医疗设备里拆的,应该能提取细胞样本。”
  张铁柱跟在后面,拎著一个金属箱。“温控舱组装好了。”他说,“三段加热,误差不超过零点五度。”
  李梦瑶走进来时,手里拿著一份列印纸。“我查了公开资料库。”她说,“关於基因编辑的工具链,目前最稳定的还是归巢酶系统。我们需要一段可编程的引导序列。”
  “那就做。”林风说。
  “难点在精度。”她把纸放在桌上,“如果切错位置,可能激活不该动的基因。我们没有大设备,只能手动构建反应流程。”
  “一步步来。”周雨晴坐到终端前,“先跑个模擬。输入已知的缺陷序列,看能不能定位修復点。”
  “用哪个模型?”陈小满问。
  “r-02系列。”她说,“上次肌肉修復的数据可以反推。既然药剂能让细胞再生,说明它触发了某些沉默基因。”
  林风点头。“我们可以假设,再生因子不是直接修补组织,而是打开了某个开关。”
  “那就从这里切入。”李梦瑶翻开笔记本,“列出可能相关的基因位点。重点看调控细胞分裂和分化的那一类。”
  四个人围到桌前。屏幕上开始加载数据。
  第一行代码跳出来时,外面天已经亮了。
  八点十七分,初步筛选完成。屏幕上列出十二个候选基因。
  “排除七个。”李梦瑶指著其中几个,“这些和免疫有关,动了会引发排异。”
  剩下五个。
  “这个呢?”陈小满指最后一个,“编號xq-14,功能不明,但每次注射后活性都上升。”
  “值得试。”周雨晴调出波形图,“它的表达时间刚好在修復启动前三分钟。”
  “可能是信號触发点。”张铁柱说。
  “那就锁定它。”林风说,“下一步,设计引导序列。”
  周雨晴新建文件夹,命名为“corrector_v1”。她开始输入碱基序列,每敲一个字母都停顿一下,反覆核对。
  “用腺嘌呤配对胸腺嘧啶。”她说,“这段要完全匹配靶点。”
  “旁边加保护框。”李梦瑶提醒,“防止脱靶切割。”
  “加上。”她继续打字。
  十一点二十三分,第一条引导链完成。共八十九个碱基。
  “导出。”她说,“列印模板。”
  印表机嗡嗡响起来。一张薄纸缓缓送出。
  陈小满接过纸,对著光看。“没问题,序列清晰。”
  “准备合成。”张铁柱打开微型反应舱,“溶剂预热,酶液注入。”
  林风站在旁边看著。他知道这一步不能出错。一旦合成失败,就得重新提取原料。
  “开始吧。”他说。
  周雨晴把模板放入读取槽。机器自动扫描,將序列转化为化学指令。
  滴——
  第一道提示音响起。
  液体在透明管道中流动,混合,变色。
  十五分钟后,显示屏跳出【合成完成】。
  “取出產物。”李梦瑶戴上手套。
  她打开舱门,用移液枪吸取一滴溶液,滴入检测仪。
  几秒钟后,结果出现。
  “序列正確率百分之九十六。”她说,“有两个碱基错配。”
  “不算高。”陈小满皱眉。
  “但我们能接受。”周雨晴说,“第一次手动构建,这个精度够用了。”
  “需要优化吗?”张铁柱问。
  “先不做。”李梦瑶合上仪器,“接下来要做的是验证功能。能不能真正引导编辑。”
  “怎么试?”林风问。
  “用细胞模型。”她说,“找一组带突变的细胞,加入我们做的引导序列,再配合现有的修復机制,看是否能定点修正。”
  “我来准备样本。”陈小满转身走向培养区。
  下午一点,实验重启。
  他们选了三组细胞。每组都带有相同的基因缺陷,会导致蛋白摺叠异常。
  第一组不处理,作为空白对照。
  第二组只加修復药剂。
  第三组加修復药剂和新做的引导序列。
  “倒计时开始。”周雨晴说。
  药剂注入。
  所有人盯著监控屏。
  三十分钟后,第一组无变化。
  第二组细胞开始活跃,但蛋白仍错误摺叠。
  第三组不同。萤光標记显示,某个区域的信號突然增强。
  “xq-14位点被激活了。”李梦瑶盯著图像,“而且持续稳定。”
  “再等十分钟。”林风说。
  时间到。检测结果显示,第三组中有百分之七十三的细胞完成了正確摺叠。
  “成功了。”陈小满低声说。
  “不是完全成功。”李梦瑶指出,“还有四分之一没响应,说明效率不够。”
  “但方向是对的。”周雨晴调出数据对比图,“加了引导序列的那一组,修正率比单独用药高出五倍。”
  “我们可以改进。”林风说,“提高序列纯度,调整剂量比例。”
  “下次合成用双层校验。”张铁柱建议,“加一次沉淀提纯。”
  “好。”周雨晴记下要点,“v2版本明天就能做。”
  李梦瑶把结果存入加密分区。文件名標为【corrector_test_01】。
  “这件事不能停。”她说,“如果我们能把这个流程固定下来,就能实现真正的基因修正。”
  “不只是修正。”林风说,“以后还能预防。比如有人天生携带致病基因,我们可以在早期干预。”
  “前提是安全。”她看著他,“不能再靠人试。”
  “我知道。”他说,“所以我们要建標准流程。每一步都有记录,有验证。”
  晚上七点,大家重新分工。
  周雨晴负责引导序列叠代。
  李梦瑶主攻检测方法。
  陈小满和张铁柱搭建新的反应平台,增加过滤环节。
  林风回到角落的合成仪前。他打开灰色盒子,取出另一块晶片残片。
  掌心合拢。
  几秒后,粉末落下。
  他倒入新溶剂,加入改良催化剂,设定程序。
  机器启动。
  屏幕上跳出提示:
  【反应进程启动】
  【预计完成时间:4小时18分钟】
  他坐下等著。
  九点四十分,周雨晴走过来,手里拿著平板。
  “我重算了v2的序列。”她说,“把错配的位置改了,还加了两个稳定结构。”
  “发我一份。”他说。
  她递过平板。他快速扫了一遍。
  “可以。”他说,“按这个做。”
  她没走。“你还在等合成结果?”
  “嗯。”
  “白天的事……你觉得真能做成?”
  “已经在做了。”他说。
  “我是说,以后真的能给人用?”
  “先从动物实验开始。”他说,“找到安全剂量,再推进到临床路径。”
  她点点头,没再问。
  凌晨一点,程序结束。
  林风打开容器。
  里面是一颗稍大的晶体,顏色更深。
  他取出,放进新瓶。
  標籤写下:
  【r-02-crystal-2】
  第二天上午十点,新一批引导序列进入合成阶段。
  反应舱运行中,周雨晴突然叫了一声。
  “等等。”
  她盯著屏幕。
  “第三次模擬跑出异常结果。”
  “哪里不对?”李梦瑶走过去。
  “引导序列在完成任务后没有降解。”她说,“它留在细胞里,还在轻微活动。”
  “会怎样?”
  “长期存在可能导致误识別。”她指著图表,“如果它开始结合类似序列,就可能剪掉不该剪的地方。”
  “有办法解决吗?”
  “加自毁开关。”她说,“在序列末端加一段定时分解码。进入细胞两小时后自动断裂。”
  “怎么做?”
  “我已经设计好了。”她调出新方案,“v3版本,加入响应型终止结构。”
  “什么时候能试?”
  “今天下午。”
  中午十二点,v3序列开始合成。
  这次他们用了双重纯化流程。张铁柱守在设备旁,每隔十分钟检查一次压力值。
  陈小满负责记录参数变化。
  三点十八分,合成完成。
  检测结果显示,序列正確率提升至百分之九十八点七。
  “导入测试模型。”周雨晴说。
  新一轮实验启动。
  五点零七分,结果出来。
  引导序列准確绑定目標,在两小时后完全分解。
  未发现脱靶跡象。
  “成了。”陈小满鬆了口气。
  李梦瑶看著报告,许久没说话。
  然后她说:“我们可以准备下一步了。”
  林风站在操作台前,看著屏幕上的数据流。
  他知道,真正的挑战才刚开始。
  周雨晴走到他身边,轻声问:“下一个目標是什么?”
  他看著那串不断跳动的碱基序列,说:
  “我们得试试,能不能让这个东西,只听人的命令。”